Wellcome Sanger Institute — genomikos ir genetikos tyrimų centras
Wellcome Sanger Institute — pasaulinis genomikos ir genetikos tyrimų centras prie Kembridžo: žmogaus genomo, patogenų ir bioinformatikos inovacijos.
"Wellcome Sanger Institute", anksčiau vadintas Sangerio centru ir "Wellcome Trust Sanger Institute", yra ne pelno siekiantis Didžiosios Britanijos genomikos ir genetikos tyrimų institutas. Jį daugiausia finansuoja "Wellcome Trust". Institutas atlieka tiek fundamentinius, tiek taikomuosius tyrimus, siekdamas pagerinti supratimą apie genų vaidmenį sveikatoje, ligose ir visuomenės sveikatos iššūkių sprendime.
Institutas įsikūręs "Wellcome Genome Campus" teritorijoje netoli Hinkstono kaimo, esančio netoli Kembridžo. Šiame miestelyje taip pat veikia Europos bioinformatikos institutas. Institutas įkurtas 1992 m. ir pavadintas dvigubo Nobelio premijos laureato Frederiko Sangerio vardu. Jis buvo sumanytas kaip didelio masto DNR sekoskaitos centras. Jis dalyvavo Žmogaus genomo projekte, o vėliau labiausiai prisidėjo prie auksinio standarto žmogaus genomo sekos sudarymo. Nuo pat pradžių institutas vykdė dalijimosi duomenimis politiką ir daugelį mokslinių tyrimų atlieka bendradarbiaudamas.
Nuo 2000 m. institutas išplėtė savo misiją, kad suprastų genetikos vaidmenį sveikatai ir ligoms. Šiuo metu Institute dirba apie 900 žmonių ir atliekami keturios pagrindinės mokslinių tyrimų sritys: žmogaus genetika, patogenų genetika, pelių ir zebražuvių genetika bei bioinformatika. Tyrimų spektras apima tiek genomo sekoskaitą, tiek funkcinius tyrimus modeliniuose organizmuose ir didelių duomenų analizes.
Istorija ir misija
Wellcome Sanger Institute įkurtas kaip centras, skirtas spartinti didelio masto sekoskaitos darbus ir kurti technologijas bei metodus, reikalingus genomikos plėtrai. Jo misija apima naujų tyrimų metodų diegimą, biologinių duomenų atvėrimą mokslui ir bendradarbiavimą su universitetais, klinikomis bei privačiu sektoriumi. Institutas didelį dėmesį skiria moksliniams duomenims padaryti prieinamiems visuomenei ir akademinei bendruomenei, laikydamasis aukštų etikos ir duomenų valdymo standartų.
Tyrimų kryptys ir veikla
- Žmogaus genetika: atliekami genomo asociacijos tyrimai, retų genetinių ligų paieška, populiacijų genetika ir susirgimų predispozicijos analizės. Tyrimai padeda suprasti genų įtaką ligų patogenezei ir atrasti potencialius gydymo taikinius.
- Patogenų genetika: institutas vykdo mikroorganizmų genomikos tyrimus, kurie leidžia stebėti ligų protrūkius, suprasti atsparumo vaistams mechanizmus ir palaikyti visuomenės sveikatos atsaką (pvz., didelio masto SARS‑CoV‑2 sekų generavimas ir analizė pandemijos metu).
- Modeliniai organizmai (pelės ir zebražuvis): funkcinių genomikos eksperimentų dėka tiriamas genų vaidmuo vystymuisi ir ligoms. Pelių ir zebražuvių modeliai naudojami genų funkcijoms nustatyti ir eksperimentinei validacijai.
- Bioinformatika ir duomenų infrastruktūra: kuriami analizės metodai, duomenų bazės ir programinė įranga dideliems biologiniams duomenų rinkiniams tvarkyti bei interpretuoti.
Technologijos ir infrastruktūra
Institutas turi aukštos talpos sekoskaitos platformas, pažangias laboratorijas genetiniams ir funkcinės genomikos tyrimams bei IT infrastruktūrą dideliems duomenų srautams apdoroti. Daug dėmesio skiriama automatizavimui, kokybės kontrolei ir standartizavimui, kad rezultatai būtų palyginami ir tvarūs ilgalaikiams projektams.
Įtakos pavyzdžiai
- Esminis indėlis į Žmogaus genomo projekto pabaigą ir tolesnį žmogaus genomų referencinių sekų kūrimą.
- Didelio masto ligų ir populiacijų genetikos tyrimai, kurie formuoja supratimą apie genetinius rizikos veiksnius ir medikamentų taikinius.
- Reikšmingas vaidmuo patogenų genomikos srityje — greita sekų analizė ir dalyvavimas nacionalinėse bei tarptautinėse genomikos iniciatyvose, padedant stebėti protrūkius ir informuoti visuomenės sveikatos sprendimus.
- Funkcinės genomikos programos su pelėmis ir zebražuvėmis, kurios padeda susieti genų sekas su konkrečiomis biologinėmis funkcijomis ar ligų fenotipais.
Bendradarbiavimas, duomenų prieinamumas ir etika
Institutas tradiciškai puoselėja atviro duomenų dalijimosi kultūrą, leidžiančią mokslininkams visame pasaulyje naudotis sukauptais genomikos duomenimis. Tyrimai vykdomi bendradarbiaujant su universitetais, ligoninėmis, viešosiomis sveikatos institucijomis ir privačiu sektoriumi. Taip pat didelis dėmesys skiriamas dalyvaujančių žmonių teisių, duomenų privatumo ir tyrimų etikos užtikrinimui — sprendžiami sutikimo, anonimizavimo ir duomenų valdymo klausimai.
Švietimas ir visuomenės įtraukimas
Wellcome Sanger Institute teikia mokymus, kursus ir viešas programas, skirtas tiek mokslininkams, tiek plačiajai visuomenei. Tai apima bioinformatikos mokymus, stažuotes ir viešas paskaitas, kuriomis siekiama didinti supratimą apie genomiką ir jos taikymą medicinoje bei visuomenės sveikatai.
Visumoje, Wellcome Sanger Institute yra viena iš pasaulyje žinomų genomikos institucijų, kuri savo technologinėmis galimybėmis, duomenų atvirumu ir tarptautiniu bendradarbiavimu ženkliai prisideda prie genetikos mokslo ir jo pritaikymo visuomenės sveikatai gerinti.
Klausimai ir atsakymai
K: Kas yra Wellcome Sangerio institutas?
A: Wellcome Sangerio institutas yra ne pelno siekiantis Didžiosios Britanijos genomikos ir genetikos tyrimų institutas.
K: Kas finansuoja Wellcome Sangerio institutą?
A: Wellcome Sangerio institutą daugiausia finansuoja Wellcome Trust.
K: Kur įsikūręs Wellcome Sangerio institutas?
A.: Wellcome Sangerio institutas yra įsikūręs Wellcome Genome Campus netoli Hinkstono miestelio, netoli Kembridžo, ir dalijasi miesteliu su Europos bioinformatikos institutu.
K: Kieno vardu institutas pavadintas ir kodėl jis buvo įkurtas?
A: Institutas pavadintas dvigubo Nobelio premijos laureato Frederiko Sangerio vardu ir buvo įkurtas 1992 m. kaip didelio masto DNR sekvenavimo centras.
K.: Koks buvo instituto indėlis į Žmogaus genomo projektą?
A.: Institutas dalyvavo Žmogaus genomo projekte ir įnešė didžiausią indėlį į auksinio standarto žmogaus genomo sekos sudarymą.
K.: Į kokius mokslinius tyrimus Institutas orientuojasi nuo 2000 m.?
A: Nuo 2000 m. Institutas išplėtė savo misiją, siekdamas suprasti "genetikos vaidmenį sveikatai ir ligoms".
K: Kokios yra keturios pagrindinės Instituto mokslinių tyrimų sritys?
A: Keturios pagrindinės Instituto mokslinių tyrimų sritys yra žmogaus genetika, patogenų genetika, pelių ir zebražuvių genetika ir bioinformatika.
Ieškoti