Bėjus pradėjo dirbti kino pramonėje stažuodamasis pas Džordžą Luką, kai jam buvo penkiolika metų, ir pildė filmo "Dingusios arkos ieškotojai", kuris, jo manymu, turėjo būti siaubingas, siužetinius planus. Po filmo peržiūros kino teatre jo nuomonė pasikeitė ir ši patirtis jam padarė tokį įspūdį, kad jis nusprendė tapti kino režisieriumi. 1986 m. jis baigė Wesleyano universitetą, įgijo anglų kalbos ir kino specialybę. Buvo brolijos "Psi Upsilon" narys ir mėgstamas kino istorikės Jeanine Basinger mokinys. Baigdamas studijas mokėsi Pasadenos dizaino koledže "Art Center College of Design", kur taip pat studijavo kiną. []
Praėjus dviem savaitėms po to, kai baigė magistro studijas, Michaelas Bay'us pradėjo dirbti "Propaganda Films", kurdamas reklaminius ir muzikinius vaizdo klipus.[] Jo 90 sekundžių trukmės Antrojo pasaulinio karo įkvėptą "Coca-Cola" reklamą įsigijo įrašų kompanija "Capitol Records". Jo pirmoji nacionalinė Raudonojo Kryžiaus reklama 1992 m. pelnė "Clio" apdovanojimą.
Sėkmingai filmuodamasis muzikiniuose vaizdo klipuose Bay'us atkreipė prodiuserių Jerry Bruckheimerio ir Dono Simpsono dėmesį, kurie pasirinko jį režisuoti savo pirmąjį pilnametražį filmą "Blogi berniukai". Filmas buvo nufilmuotas 1994 m. Majamyje, o pagrindinius vaidmenis jame atliko Willas Smithas ir Martinas Lawrence'as. Šis veiksmo filmas tapo kertiniu vaidmeniu V. Smithui, kuris tuo metu iš televizijos persikėlė į kiną. Filmavimasis Majamyje buvo gera patirtis Bay, kuris vėliau šiame mieste turėjo namą ir praleisdavo jame daug laiko. Filmas buvo baigtas kurti už 19 mln. dolerių, o 1995 m. vasarą kino teatrų kasose surinko 141 mln. dolerių. Sėkmė lėmė stiprią Bay'aus partnerystę ir draugystę su Jerry Bruckheimeriu.
Kitame jo filme "Uola" (The Rock, 1996) veiksmo filmo veiksmas vyko Alkatraso saloje ir San Francisko įlankos rajone. Filme vaidino Šonas Koneris, Nikolas Keidžas ir Edas Harisas. Jį taip pat prodiusavo Džeris Brukhaimeris ir Donas Simpsonas, pastarasis mirė likus penkiems mėnesiams iki filmo premjeros. Filmas skirtas jam. Connery ir Cage'as 1997 m. MTV kino apdovanojimuose laimėjo "Geriausio ekrano dueto" apdovanojimą, o filmas buvo nominuotas "Oskarui" geriausio garso kategorijoje už Grego P. Russello, Kevino O'Connello ir Keitho A. Westerio darbą.
1998 m. Bay vėl bendradarbiavo su Jerry Bruckheimeriu, šį kartą kaip vienas iš prodiuserių, ir režisavo veiksmo ir nuotykių filmą "Armagedonas". Filme apie grupę kietų naftos gręžėjų, kuriuos NASA siunčia nukreipti asteroidą nuo susidūrimo su Žeme, vaidino Bruce'as Willisas, Billy Bobas Thorntonas, Benas Affleckas ir Liv Tyler. Filmas buvo nominuotas keturiems "Oskarams" 71-ojoje "Oskarų" ceremonijoje, įskaitant geriausią garsą, geriausius vaizdo efektus, geriausią garso montažą ir geriausią originalią dainą. Per premjeros dieną filmas uždirbo 9,6 mln. dolerių, o iš viso per pirmąjį savaitgalį - 36,5 mln. dolerių. Filmo gamybos biudžetas - 140 mln. dolerių - buvo vienas didžiausių 1998 m. vasarą. Pasaulyje "Armagedonas" uždirbo daugiau nei 553 mln. dolerių.
Vėlesnė karjera
2001 m. Bėjus režisavo "Perl Harborą". Filme vaidino Benas Affleckas, Joshas Hartnettas, Kate Beckinsale ir Cuba Goodingas jaunesnysis. Filmas buvo išleistas 2001 m. Atminimo dienos savaitgalį. Vėlgi Bėjus filmą prodiusavo kartu su Džeriu Brukheimeriu. Filmas gavo keturias "Oskaro" nominacijas, tarp jų - už geriausią garsą, geriausius vaizdo efektus, geriausią garso montažą ir geriausią dainą. Kevinas O'Connellis vėl gavo dar vieną nominaciją už geriausią garsą, tačiau nelaimėjo. Perl Harboras laimėjo garso montažo kategorijoje. Maiklas Bėjus taip pat režisavo muzikinį vaizdo klipą nominuotam vokalistės Faith Hill kūriniui "There You'll Be".[] Nepaisant visos kritikos, kurios Maiklas Bėjus sulaukė dėl šio filmo, "Perl Harboras" išliko pagrindinių kino hitų sąraše, nes pasižymėjo siužetu, su kuriuo žiūrovai, ypač jaunimas, gali susišnekėti, ir specialiaisiais efektais, dėl kurių filmas buvo labai tikroviškas.
Bay'us su Willu Smithu ir Martinu Lawrence'u vėl susivienijo filme "Blogi berniukai II" (Bad Boys II), kuris taip pat buvo penktasis Bay'aus bendradarbiavimas su Jerry Bruckheimeriu. Filmas uždirbo 138 milijonus JAV dolerių šalies viduje, kurių pakako padengti gamybos biudžetą, ir 273 milijonus JAV dolerių visame pasaulyje, t. y. beveik dvigubai daugiau nei pirmasis filmas.
2005 m. Bay'us režisavo mokslinės fantastikos filmą "Sala", kuriame pagrindinius vaidmenis atliko Ewanas McGregoras ir Scarlett Johansson. Tai buvo pirmasis filmas, kurį Maiklas Bėjus kūrė be Džerio Brukheimerio. Filmo "Sala" gamyba kainavo 126 mln. dolerių. Filmas uždirbo 46 mln. dolerių šalies viduje ir 172 mln. dolerių visame pasaulyje. M. Bėjus teigė, kad jam nepatiko vietinė rinkodaros kampanija, nes ji klaidino žiūrovus dėl tikrosios filmo temos.
2007 m. kartu su Stevenu Spielbergu režisavo ir prodiusavo vaidybinį filmą "Transformeriai", sukurtą pagal "Transformerių" frančizę. Filmas JAV ir Kanadoje buvo išleistas 2007 m. liepos 3 d., o liepos 2 d. 20.00 val. vyko išankstiniai seansai. 8,8 mln. dolerių uždirbo išankstiniai seansai, o per pirmąją bendro rodymo dieną filmas surinko 27,8 mln. dolerių - tai buvo antradienio kasų lankomumo rekordas.[] Filmas sumušė "Žmogaus-voro 2" liepos 4 d. pasiektą rekordą ir uždirbo 29 mln. dolerių. Per premjerinį savaitgalį "Transformeriai" uždirbo 70,5 mln. dolerių, o per premjerinę savaitę - 155,4 mln. dolerių, taip pasiekdamas didžiausios ne filmo tęsinio premjerinės savaitės rekordą.[] Nuo 2007 m. lapkričio mėn. filmas uždirbo daugiau nei 319 mln. dolerių šalies viduje ir daugiau nei 708 mln. dolerių visame pasaulyje.
Bėjus grįžo kaip filmo "Transformeriai" režisierius ir vykdomasis prodiuseris: Išleistas 2009 m. birželio 24 d. ir visame pasaulyje uždirbo daugiau nei 832 milijonus dolerių. Nors filmas sulaukė daugiausia neigiamų kritikų vertinimų, įskaitant agresyvius amerikiečių kino kritikų, tokių kaip Rogeris Ebertas, Maiklas Filipsas ir Deividas Denbis (kuris pavadino Bėjų "stulbinamai, beveik piktybiškai netalentingu"), filmas buvo palankiai priimtas tikslinės auditorijos ir tapo vienu pelningiausių 2009 m. filmų. 2010 m. jis pelnė septynias "Auksinių aviečių" nominacijas ir laimėjo tris: ir apdovanojimus: "Blogiausias filmas", "Blogiausias režisierius" ir "Blogiausias scenarijus".
Bay'us režisavo Transformeriai: Mėnulio tamsa, išleistas 2011 m. birželio 28 d. Jis gali režisuoti frančizės "Blogi berniukai" tęsinį arba "nedidelį" filmą, kurį kuria jau kelerius metus ir kuris preliminariai vadinasi "Pain & Gain". Tikro nusikaltimo istorija, paremta įvykiais, aprašytais Pete'o Collinso straipsnyje "Miami Herald", pasakoja apie grupę nevykėlių kultūristų, kurie dirba kartu, kad įvykdytų apiplėšimą.
Bay prodiusavo "DreamWorks" filmą "Aš esu numeris keturi", paremtą Pittacus Lore romanų serija, kurią išleido "HarperCollins Children's Books". Režisierius D. J. Caruso ("Eagle Eye", "Disturbia").
