Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii yra endosimbiotinė gama proteobakterija. Jos genomas yra mažiausias iš visų žinomų bakterijų.
Ši rūšis yra endosimbiontas, esantis visose floemos sultimis mintančių vabzdžių, vadinamų psilidais, rūšyse. Endosimbiontas aptinkamas specializuotoje struktūroje, vadinamoje bakterioma.
2006 m. buvo ištirtas vienos Ca. C. ruddi genomą nustatė RIKEN (Japonija) ir Arizonos universitetas. Genomą sudaro apskrita chromosoma, kurią sudaro 159 662 bazių poros, ir jis pasižymi dideliu kodavimo tankiu (97 %), daug persidengiančių genų ir sumažintu genų ilgiu. Numatytų genų skaičius buvo 182, taip pat mažiausias užfiksuotas (NCBI-Genome). Atrodo, kad trūksta daugybės genų, laikomų gyvybiškai svarbiais, o tai leidžia manyti, kad rūšis galėjo pasiekti organelės statusą.
Palyginimui, Mycoplasma genitalium, kurios genomas yra mažiausias iš visų laisvai gyvenančių organizmų, genomą sudaro 521 genas.
Klausimai ir atsakymai
K: Kas yra Candidatus Carsonella ruddii?
A: Candidatus Carsonella ruddii yra endosimbiotinė gama proteobakterija, kurios yra visose floemos sultimis mintančių vabzdžių, vadinamų psiliais, rūšyse.
K: Kokio dydžio yra Candidatus Carsonella ruddii genomas?
A: Candidatus Carsonella ruddii genomas yra mažiausias iš visų žinomų bakterijų genomų - tai apskritiminė chromosoma, kurią sudaro 159 662 bazių poros.
K: Kiek genų numatoma turėti Candidatus Carsonella ruddii bakterijoje?
A: Candidatus Carsonella ruddii turi 182 numatytus genus, t. y. mažiausiai iš visų užregistruotų genų (NCBI-Genome).
K: Koks yra Candidatus Carsonella ruddii genomo kodavimo tankis?
A: Candidatus Carsonella ruddii genomo kodavimo tankis yra didelis - 97 %.
K: Kas yra bakteriomas?
A: Bakteriomas yra specializuota struktūra, kurioje randami Candidatus Carsonella ruddii endosimbiontai.
K: Ko trūksta Candidatus Carsonella ruddii genome?
A: Atrodo, kad Candidatus Carsonella ruddii genome trūksta daugelio gyvybei būtinų genų, o tai rodo, kad ši rūšis galėjo įgyti organelės statusą.
K: Kaip Candidatus Carsonella ruddii genomas skiriasi nuo Mycoplasma genitalium genomo?
A: Mycoplasma genitalium, kurios genomas yra mažiausias iš visų laisvai gyvenančių organizmų, genomas turi 521 geną, t. y. gerokai daugiau nei Candidatus Carsonella ruddii numatomų genų.
