Genomas
Organizmo genomas - tai visa paveldimoji informacija, užkoduota jo DNR (arba, kai kurių virusų atveju, RNR). Tai apima ir genus, ir nekoduojančias DNR sekas. Profesorius Hansas Vinkleris šį terminą sukūrė 1920 m.
Išvertus Winklerio apibrėžimą, jis skamba taip:
"Siūlau haploidinio chromosomų rinkinio išraišką genomas, kuris kartu su atitinkama protoplazma apibrėžia materialųjį rūšies pagrindą ....". p165
Tačiau nė viena haploidinė chromosoma neapibrėžia net rūšies DNR. Dėl didžiulės populiacijoje esančių alelių įvairovės kiekvienas individas yra genetiškai skirtingas. Net diploidinis individas neša genetinę įvairovę. Dėl šios priežasties Dobžanskis pirmenybę teikė "chromosomų rinkiniui", o apibrėžimas dabar turi būti platesnis nei Vinklerio apibrėžimas. Haploidinio chromosomų rinkinio genomas yra tik visos rūšies genetinės įvairovės pavyzdys.
Sąvoka "genomas" gali būti vartojama konkrečiai kalbant apie visą branduolio DNR rinkinį ("branduolio genomas"), bet gali būti vartojama ir kalbant apie organoidus, turinčius savo DNR, pavyzdžiui, mitochondrijų genomą arba chloroplastų genomą.
Genomo dydžiai
| Organizmas | Genomo dydis (bazių poros) | Pastaba |
| Virusas, bakteriofagas MS2 | 3569 | Pirmasis sekvenuotas RNR genomas |
| Virusas, SV40 | 5224 | |
| Virusas, fagas Φ-X174 | 5386 | Pirmoji DNR genomo seka |
| Virusas, fagas λ | 5×10 4 | |
| 1.6×10 5 | Mažiausias nevirusinis genomas, 2007 m. vasaris | |
| Bakterija, Escherichia coli | 4×10 6 | Geriausiai ištirta bakterija. |
| Bakterija, Solibactoer usitatus | 1×10 7 | Didžiausias žinomas bakterijų genomas |
| Protistas, Amoeba dubia | 6.7×10 11 | Didžiausias žinomas genomas, tačiau dėl jo ginčijamasi. |
| Augalas, Arabidopsis thaliana | 1.57×10 8 | 2000 m. gruodžio mėn. nustatytas pirmasis augalo genomas. |
| Augalas, Genlisea margaretae | 6.34×10 7 | Mažiausias užregistruotas žydinčio augalo genomas, 2006 m. |
| Augalas, Fritillaria assyrica | 1.3×10 11 | |
| Augalas, Populus trichocarpa | 4.8×10 8 | Pirmasis medžio genomas, 2006 m. rugsėjis |
| Mielės, Saccharomyces cerevisiae | 2×10 7 | |
| Grybelis, Aspergillus nidulans | 3×10 7 | |
| Nematodas, Caenorhabditis elegans | 9.8×10 7 | Pirmasis daugialąsčių gyvūnų genomas, 1998 m. gruodžio mėn. |
| Vabzdys, Drosophila melanogaster, dar žinomas kaip vaisinė muselė | 1.3×10 8 | |
| Vabzdys, Bombyx mori, dar žinomas kaip šilkinė kandis | 5.30×10 8 | |
| Vabzdys, Apis mellifera aka medunešė bitė | 1.77×10 9 | |
| Žuvys, Tetraodon nigroviridis, rūšis Puffer fish | 3.85×10 8 | Mažiausias žinomas stuburinių genomas |
| 3×10 9 | ||
| Žuvys, Protopterus aethiopicus dar žinomos kaip marmurinės plaučių žuvys | 1.3×10 11 | Didžiausias žinomas stuburinių genomas |
Pastaba: vienos žmogaus ląstelės DNR ilgis yra ~1,8 m (o plotis ~2,4 nanometro).
Susiję puslapiai
- Gene
- Sekos analizė
- Žmogaus genomas
- ENCODE: išsami žmogaus genomo analizė
Klausimai ir atsakymai
K: Kas yra genomas?
Atsakymas: Genomas - tai visa organizmo paveldimoji informacija, užkoduota jo DNR (arba, kai kurių virusų atveju, RNR). Tai apima ir genus, ir nekoduojančias DNR sekas.
K: Kas sukūrė terminą "genomas"?
A: Profesorius Hansas Vinkleris 1920 m. sukūrė terminą "genomas".
K: Ką Winkleris apibrėžė kaip genomą?
A: Winkleris genomą apibrėžė kaip "haploidinį chromosomų rinkinį, kuris kartu su atitinkama protoplazma apibrėžia materialųjį rūšies pagrindą".
K: Ar kiekvienas individas pasižymi genetine įvairove?
A: Taip, dėl populiacijoje esančių alelių kiekvienas individas yra genetiškai skirtingas. Net diploidiniai individai pasižymi genetine įvairove.
K: Ką reiškia, kai sakome "branduolinis genomas"?
A: Kai kalbame apie "branduolinį genomą", turime omenyje būtent visą branduolinės DNR rinkinį.
K: Ar be branduolinio genomo yra ir kitų genomų?
Atsakymas: Taip, taip, yra mitochondrijų genomų ir chloroplastų genomų, turinčių savo DNR.
