Sent Luiso Avinai
1999 m. sezonas
1998 m. reguliariajame sezone ir 1999 m. ikisezoninėse rungtynėse Warneris buvo atsarginis Sent Luiso "Rams" komandos gynėjas. Kai priešsezoninėse rungtynėse susižeidė pagrindinis gynėjas Trentas Greenas, juo tapo Warneris. Jis sužaidė vieną geriausių sezonų NFL istorijoje: iš viso atkovojo 4353 jardus, atliko 41 rezultatyvų perdavimą ir atliko 65,1 % rezultatyvių perdavimų. Labai geras "Avinų" puolimas buvo pramintas "Didžiausiu šou ant vejos". Per pirmąsias trejas rungtynes, kuriose jis buvo pagrindinis žaidžiantis gynėjas, kiekvienose rungtynėse jis atliko po tris "touchdown" perdavimus. Jis yra vienintelis NFL gynėjas istorijoje, kuriam tai pavyko padaryti, ir tik antrasis po Dano Marino, kuriam tai pavyko padaryti per pirmuosius du NFL startus.
Kadangi nedaugelis žmonių žinojo, kas yra Warneris, "Sports Illustrated" 1999 m. spalio 18 d. įdėjo jį ant savo viršelio su užrašu "Kas yra šis vaikinas?" Sezono pabaigoje jis buvo pripažintas 1999 m. NFL naudingiausiu žaidėju. NFL atkrintamosiose varžybose jis atvedė "Rams" komandą į "Super Bowl XXXIV" pergalę prieš "Tennessee Titans". Jis įmetė du "touchdown'us" ir pasiekė "Super Bowl" rekordą - 414 perdavimų jardų. Jis taip pat pasiekė Supertaurės rekordą, nes atliko 45 rezultatyvius perdavimus be perimtų kamuolių.
Iškart po "Rams" pergalės "Super Bowl" turnyre interviu davėjas paklausė Warnerio: "Kurtai, pirmiausia papasakok man apie paskutinį "touchdown" perdavimą Isaacui." Jis atsakė: "Pirmiausia turiu padėkoti savo Viešpačiui ir Gelbėtojui, esančiam aukščiau - ačiū Tau, Jėzau!" Jis buvo apdovanotas "Super Bowl" naudingiausiu žaidėju. Taip jis tapo vienu iš vos šešių žaidėjų, kurie tais pačiais metais laimėjo ir lygos MVP, ir "Super Bowl MVP" apdovanojimus. Kiti: Bartas Starras 1966 m., Terry Bradshaw 1978 m., Joe Montana 1989 m., Emmittas Smithas 1993 m. ir Steve'as Youngas 1994 m.
2000 m. sezonas
2000 m. sezone Warneris taip pat žaidė gerai. Tą sezoną Warneris ir Trentas Greenas abu žaidė gynėjais ir abu žaidė gerai. Tačiau "Rams" pralaimėjo atkrintamųjų varžybų "laukinės kortos" etapą Naujojo Orleano "Saints" komandai, daugiausia dėl to, kad jų gynyba nebuvo labai gera, nors Warneris ir kiti puolėjai buvo labai geri. Devyni iš vienuolikos pagrindinių "Rams" gynėjų buvo atleisti tarpsezoniu, o Greenas buvo išmainytas į "Kansas City Chiefs".
2001 m. sezonas
2001 m. sezone Warneris žaidė labai gerai. Jis atliko 36 rezultatyvius perdavimus, perdavė 4 830 jardų ir atliko 68,7 % perdavimų. Jis atvedė "Avinus" į geriausią NFL rezultatą 14-2 ir jie pateko į XXXVI Supertaurės turnyrą, tačiau pralaimėjo Naujosios Anglijos "Patriotams". Sezono pabaigoje jis antrą kartą buvo pripažintas naudingiausiu NFL žaidėju.
2002 ir 2003 m. sezonai
Warneris sezoną pradėjo 0-3 kaip pagrindinis žaidėjas, metė septynis perdavimus ir tik vieną prisilietimą. Ketvirtosiose rungtynėse su Dalaso "Cowboys" jis susilaužė metimo rankos pirštą. Nors vėliau sezono metu jis bandė sugrįžti, dėl traumos jis galėjo žaisti dar dvejas rungtynes ir abejas pralaimėjo. Priešingai nei jo 103,4 karjeros rezultatyvaus perdavimo rodiklio prieš tą sezoną, 2002 m. jis turėjo tik 67,4 rodiklio. Jis buvo pakeistas pagrindiniu "Rams" gynėju po to, kai 2003 m. sezono atidarymo rungtynėse su "New York Giants" šešis kartus suklydo. Jį "Rams" gynėju pakeitęs Marcas Bulgeris buvo paskirtas į du "Pro Bowls" turnyrus.
Niujorko "Giants
2004 m. birželio 1 d. "Avinai" atleido Warnerį. Vos po dviejų dienų jis pasirašė dvejų metų sutartį su Niujorko "Giants". 2004 m. sezoną jis pradėjo kaip pagrindinis gynėjas. Jis laimėjo penkerias iš pirmųjų septynerių rungtynių, tačiau po nesėkmingai sužaistų dviejų pralaimėtų rungtynių serijos pagrindiniu gynėju tapo naujokas gynėjas Eli Manningas. Vėliau "Giants" treneris Tomas Kaflinas (Tom Coughlin) sakė, kad jam nereikėjo leisti žaisti Warneriui, o reikėjo nuo pat pradžių žaisti Manningui, kad šis įgytų patirties, reikalingos pasitikėjimui savimi stiprinti. Tuo metu, kai pradėjo žaisti Manningas, "Giants" turėjo 5-4 pergalių ir pralaimėjimų rezultatą, o apskritai baigė 6-10 (vadovaujant Manningui - tik 1-6).
Arizona Cardinals
2005 m. sezonas
2005 m. pradžioje Warneris pasirašė vienerių metų 4 mln. dolerių vertės sutartį su Arizonos "Cardinals". Netrukus treneris Dennisas Greenas jį paskyrė pagrindiniu gynėju. Prieš susižeisdamas kirkšnį jis sužaidė blogai trejas rungtynes. Tada jį pakeitė buvęs įžaidėjas Joshas McCownas. J. McCownas dvejose rungtynėse Warnerio traumos metu žaidė pakankamai gerai, kad treneris J. Greenas iki sezono pabaigos J. McCowną paskirtų pagrindiniu įžaidėju.
Kadangi Warneris buvo atsarginis gynėjas, daugelis manė, kad jis niekada nebebus pagrindinis gynėjas. Bet kadangi McCown blogai žaidė dvejose rungtynėse iš eilės, treneris Greenas pagrindiniu gynėju paskyrė Warnerį. Kitas tris savaites jis žaidė gerai, tačiau 15-ąją savaitę jo sezonas baigėsi, kai iš dalies plyšo MCL.
2006 m. sezonas
2006 m. vasario 14 d. Warneris pasirašė naują trejų metų sutartį su "Cardinals". Sutartyje buvo numatytas 18 mln. JAV dolerių bazinis atlyginimas, bet jei jis gerai žais, per trejus metus gali gauti iki 22 mln. dolerių.
2006 m. sezono 3 savaitę Warneris per 76-ąsias rungtynes peržengė 20 000 jardų ribą. Tai buvo vieneriomis rungtynėmis daugiau nei rekordininkas Danas Marino, tačiau Warneris tai padarė 9-aisiais metais, o Marino - 5-aisiais. Mattui Leinartui prastai sužaidus tris 2-4 savaičių rungtynes, ketvirtosios savaitės ketvirtajame ketvirtyje Warneris pakeitė naujoką Leinartą. 16-ąją savaitę Leinartas patyrė peties traumą rungtynėse su "San Francisco 49ers", todėl Warneris galėjo žaisti pirmą kartą nuo 4-osios savaitės. Tose rungtynėse jam sekėsi gerai, o "Cardinals" laimėjo rungtynes.
2007 m. sezonas
Trečiose 2007 m. sezono rungtynėse su Baltimorės "Ravens" Warneris išėjo nuo atsarginių žaidėjų suolelio, nes Leinartas vėl žaidė prastai. Jis vadovavo sugrįžimui, atlikdamas 15 perdavimų iš 20 bandymų, per kuriuos pelnė 258 jardus ir 2 touchdownus. Tai leido pasiekti lygiąsias (23:23), tačiau "Ravens" paskutinę sekundę įmušus įvartį, Arizona pralaimėjo rungtynes 26:23. 2007 m. rugsėjo 30 d. per ketvirtosios savaitės rungtynes su "Pittsburgh Steelers" jis pakeitė Leinartą, nes šis vėl žaidė prastai. Vėliau Leinartas buvo įtrauktas į traumuotų žaidėjų rezervą, todėl likusią 2007 m. sezono dalį Warneris buvo paskirtas įžaidėju.
2007 m. sezone Warneris atliko 27 rezultatyvius perdavimus ir tik vienu atsiliko nuo "Cardinals" klubo rekordo. Kadangi jis žaidė gerai, už metus jam buvo skirta 1 mln. dolerių premija. Jo 3417 perimtų jardų, 27 rezultatyvūs perdavimai ir 89,8 rezultatyvaus perdavimo reitingas buvo geriausi nuo 2001 m. sezono.
2008 m. sezonas ir atkrintamosios varžybos
Mattas Leinartas buvo paskirtas "Cardinals" pradininku 2008 m., tačiau Kenas Whisenhuntas sakė, kad gali atsitikti taip, jog Warneris taps "Cardinals" pradininku prieš prasidedant sezonui. 2008 m. rugpjūčio 30 d. Warneris buvo paskirtas pagrindiniu žaidėju. Tą sezoną Warneris sužaidė labai gerą sezoną, o 2008 m. gruodžio 16 d. buvo paskirtas pradedančiuoju NFC komandos gynėju 2009 m. "Pro Bowl" turnyre. Warneris ir "Cardinals" laimėjo visas trejas atkrintamųjų varžybų rungtynes, tačiau pralaimėjo "Super Bowl" rungtynes Pitsburgo "Steelers" komandai. Dėl to Warnerio "Super Bowl" rungtynių rekordas yra 1-2. Džeimsas Dobsonas, organizacijos "Focus on theFamily" pradininkas, palaikė Vornerį ir net 2009 m. sausio 30 d. per radiją pakartojo Vornerio ir jo žmonos įrašą.